Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms