Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trim58Q5NCC9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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