Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms