Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox3aQ4TU90 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms