Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa20Q45VN2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa20Q45VN2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms