Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin28bQ45KJ6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lin28bQ45KJ6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lin28bQ45KJ6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lin28bQ45KJ6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28bQ45KJ6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28bQ45KJ6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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