Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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