Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms