Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbof1Q3V079 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbof1Q3V079 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms