Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Prdm6Q3UZD5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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