Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm5aQ3UXZ9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms