Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp953Q3UPV7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp953Q3UPV7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms