Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms