Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms