Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edc4Q3UJB9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms