Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms