Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms