Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms