Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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