Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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