Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem35bQ3U0Y2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem35bQ3U0Y2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms