Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srsf6Q3TWW8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms