Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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