Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms