Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
1700066B19RikQ3TS39 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms