Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms