Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afvQ3THW5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms