Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam107bQ3TGF2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms