Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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