Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

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Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rtl9Q32KG4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rtl9Q32KG4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rtl9Q32KG4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rtl9Q32KG4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rtl9Q32KG4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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