Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms