Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms