Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms