Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms