Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms