Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neurl1bQ0MW30 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms