Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms