Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms