Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms