Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nfe2Q07279 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms