Protein–RNA interactions for Protein: Q07230

Zscan2, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan2Q07230 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zscan2Q07230 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms