Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms