Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mex3cQ05A36 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms