Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms