Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms