Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Thbs2Q03350 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Thbs2Q03350 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms