Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms