Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms