Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snai1Q02085 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai1Q02085 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms