Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms